Молитва Ефрема Сирина читается на богослужениях в течение Великого поста до Великой среды Страстной седмицы, кроме субботы и воскресенья, а также в келейной молитве дома.

Молитва Ефрема Сирина читается дважды. При первом чтении после каждого прошения следует земной поклон. Затем 12 раз про себя читается молитва: «Боже, очисти мя, грешнаго» — с поясными поклонами. И далее целиком молитва Ефрема Сирина, после которой кладется один земной поклон.

Эта короткая и простая молитва занимает важное место во всем великопостном богослужении, потому что в ней особым образом перечисляются все отрицательные и положительные элементы покаяния и дается перечень личных подвигов каждого христианина. Их цель прежде всего — освобождение от какого-то основного духовного недуга, который мешает вступить на путь обращения к Богу.